在实践过程中，农村土地所有权较为明晰，鲜少存在争议，但农村集体建设用地使用权往往因村集体私下流转，导致使用权归属存在较多纠纷，因此自然资源部在本轮深化入市试点过程中要求入市地块必须办理“两权登记”，即集体土地所有权及集体建设用地使用权登记，其目的是排除存在权属纠纷的集体经营性建设用地入市后带来的法律诉讼，避免给深化农村集体经营性建设用地入市试点带来负面影响。